Девочка вынуждена перебраться из большого города в деревню из-за работы отца. В школе одноклассники не горят желанием дружить с новенькой. И хотя есть среди них мальчик, которого ей хотелось бы узнать получше, она не предпринимает для этого никаких шагов, так как боится, что он захочет её обидеть. Вскоре она начинает ненавидеть деревню и отчаянно скучать по городу, но тут ей встречается Бог ветра.

Третьеклассница Химэно переезжает в огромный особняк в провинции. Вскоре она обнаруживает, что это дом ниндзя! Ниндзя Акамаки (aka — красный), Аомаки (ao — синий) и Кииромаки (ki iro — жёлтый) принимают Химэно за принцессу и помогают ей решать проблемы при помощи своих уникальных способностей. Но это лишь малая часть их возможностей! Когда Аомаки и Кииромаки объединяются, они образуют Мидоримаки (midori — зелёный). Схожим образом при объединении Акамаки и Аомаки образуется Мурасакимаки (фиолетовый), а когда объединяются Акамаки и Кииромаки, образуется Дайдаймаки (оранжевый). Жизнь с этими разноцветными ниндзя только начинается, когда они узнают, что сильный ураган направляется в сторону особняка. Что произойдет с семьей Химэно? Смогут ли разноцветные ниндзя защитить девочку?

Айко живёт в святилище с раздвижной дверью, роспись на которой почему-то закончена лишь наполовину. Девочка мечтает дорисовать её, когда вырастет. Однако у 17-летней Айко совсем нет времени на мечты. Внезапно перед святилищем появляется странный человек. Дед Айко и главный священник предлагают человеку остаться в храме, но Айко возражает. Так или иначе девушка понимает, что прибывший молодой человек не проявляет зла, и со временем сама с ним сближается. Какова истинная личность гостя?