Элитное военное подразделение Корпус обороны защищает мирных жителей от кайдзю, которые уже много лет появляются по всей Японии. Останки монстров убирают профессиональные уборщики, один из которых — Кафка Хибино. Парень недоволен своей работой — ещё подростком он хотел вступить в Корпус обороны, но все его попытки не увенчались успехом. Однажды у него появляется возможность осуществить свою мечту, когда в его тело проникает паразит, и Кафка получает способность превращаться в кайдзю.

Начало XV века, Польша. Юный и одарённый Рафаль хочет учиться теологии, но однажды он сталкивается с Хубертом и революционной теорией о вращении Земли вокруг Солнца, что противоречит учению церкви. Вместе они изучают астрономию и проводят исследования, рискуя жизнью. Их деятельность привлекает внимание инквизитора Новака.

10 лет назад открылись врата в другой мир, где людям дозволено убивать монстров. Так появились охотники, преследующие и уничтожающие тварей. Но не каждому из них суждено повысить свой уровень и стать сильнее. Сон Джин-у был охотником низшего E-ранга, у которого не было ни единого шанса продвинуться по ранговой лестнице, пока однажды он случайно не очутился в подземелье D-ранга. Чуть не погибнув от рук чудовищ, Джин-у открывает секрет повышения уровня.