Мюнхен, 1923 год. Два года прошло с тех пор, как Эдварда Элрика забросило в наш мир из его собственного мира, где остался его родной край, друзья и младший брат, Альфонс. Лишившись возможности применять алхимию, Эд всё это время занимался исследованиями в области ракетной техники вместе с Альфонсом Хайдерихом - молодым человеком, очень похожим на его младшего брата, - надеясь, что таким образом отыщет способ вернуться домой. До сих пор его труды оказывались тщетны, но когда он узнал, что Общество Туле - оккультистская группа, близко связанная с нацистской партией, - обнаружила ключ к местонахождению легендарной, мистической страны Шамбалы, надежды Эдварда вспыхнули с новой силой. Тем временем в своём родном мире Альфонс Элрик все глубже погружается в тайны алхимии, ища способ воссоединиться со своим старшим братом.

Мир состоит из квантов, жизнь из воспоминаний, а картинка складывается из отдельных штрихов. Что есть жизнь в масштабах времени — мгновение между прошлым и будущим, границу между которыми способна очертить лишь наша память. Ноейн — аниме о некой взаимосвязи времен, о предопределенности и выборе, о памяти и забытом. Только увидеть единую паутину мира можно, лишь собрав вместе все ниточки отдельных судеб. Тем не менее, в Ноейн авторы попытались воплотить свою интерпретацию классической проблемы пространства-времени при том, что одноплановой сюжетной линии нет, как и одной конкретной идеи в нем нет. Есть определенная концепция бытия, которую хотят донести до зрителей, используя незамысловатую тинейджерскую историю. Поэтому сюжет Ноейн напоминает полотно, из которого постоянно лезут во все стороны нитки.

Человечество создало базу на лунной поверхности, чтобы использовать ее, как форпост в освоении Марса. Однако падение в 2101 космической станции «Фрипорт» на Землю вызвало экологическую катастрофу. В войнах за природные ресурсы планеты человеческая цивилизация погибла и Земля превратилась в мертвую планету. Те, кто остались на Луне, отказались от планов освоения Марса, и, поставив цель обеспечить выживание человечества, занялись исследованиями и основали республику Эдем. Спустя сто лет после краха цивилизации, жители Эдема, единственные представители человечества, находясь под неусыпным наблюдением, получили обещанное стабильное существование. В период после окончания учебы до получения статуса гражданина, жителям Эдема предоставляется «6 месячный свободный статус», пока администрация не определит их социальное положение. Таким и предстает перед нами главный герой по имени Такеру, выпускник со свободным статусом, жаждущий приключений. Однако жизнь поставит перед ним не одну задачу, главной из которых будет выбор между «Свободой» и «Стабильностью».

Новая Венеция парит между прозрачно-синим небом и сине-прозрачной водой. По каналам скользят гондолы, над гондолами изогнулись мосты, а над мостами реют чайки. Новая Венеция находится на планете Аква. Юная Акари приехала на Акву с Земли, чтобы найти место в жизни, состояться и стать настоящей русалкой. Она устраивается в туристическую компанию «Ария», учится управлять гондолой, осваивает профессию гида и не устает восхищаться удивительным новым миром Аквы.

Нагаи не нравятся женщины. Ему также не нравятся мужчины. Ему нравится только один человек – его сослуживец, Сайто. Но вот Сайто женится, а Нагаи так ничего ему и не сказал. Его сердце разбито, он ненавидит невесту, ревнует жениха и страшно зол на весь мир. Вторую половину свадьбы Нагаи коротает в баре, заливая горе спиртным. Вдруг к нему подсаживается гость со стороны невесты, некий господин Хонда.

Маленькая девочка раз за разом принимает два лекарства: одно прописанное, второе – не поставленное на конвейер, но от этого не менее действенное.