В 2133 году, после глобальной войны в которой погибло более половины населения земли, город Олимп стал маяком надежды в мире разрушений и страданий. Олимп - утопия, которой управляет суперкомпьютер Гайа, а важные политические посты занимают искусственно спроектированные люди-биороиды - которым неведомы эмоции злости или ненависти. Дюнан Нант - молодая, но профессиональная военная, и Бриарюс - элитный солдат с телом киборга - напарники и возлюбленные, вместе охраняют покой идеального общества будущего. Старых друзей подвергают нешуточному испытанию, когда напарником Дюнан назначают Терея - экспериментального биороида-воина, созданного на основе ДНК Бриарюса и как две капли воды похожего на его настоящее тело.

2005 год. На фоне массовых протестов против фармацевтической компании WilPharma сотрудница правозащитной организации TerraSave Клэр Рэдфилд прибывает в аэропорт Харвардвиля. Внезапно рядом падает самолёт, который оказывается полон заражёнными T-вирусом — здание аэропорта заполоняют толпы зомби. К месту катастрофы подтягиваются военные, среди которых оказывается и Леон С. Кеннеди. Вместе с отрядом спецназа он спасает Клэр и группу выживших, в том числе сенатора Рона Дэвиса, который всячески поддерживает WilPharma.

После страшной войны территория Японии расколота на суверенные города-крепости. Город, в котором происходит действие сериала, удалось восстановить только после привлечения иностранных компаний. Соответственно они практически правят городом. Есть недовольные этим жители, но есть и те, кому все равно на кого работать - лишь бы платили. Одна из самых высокооплачиваемых работ у бойцов подразделения «Viper», правда и желающих на нее немного. Бойцы мото-мехапехоты истребляют наследие войны - автоматическое самоходное оружие, которое то тут, то там самоактивируется. Им завидуют, их боятся, их используют как разменные фигуры в политической игре. Если сумеют, потому что у «Viper» есть свое кредо.

Старшеклассник Лин, завербованный Анной Уильямс из корпорации G, должен проникнуть в Киотский университет и найти студента по имени Син Камия. Тем временем глава конгломерата «Мисима» Дзин Кадзама поручает такое же задание Алисе Босконович.

Где-то в Токио расположена комната, в которой находится чёрная сфера под названием Ганц. Время от времени в комнату телепортируются люди, которые должны были умереть в тот самый момент. Сфера снабжает их оружием и спецкостюмами и отправляет на смертельно опасное задание: убивать обосновавшихся на Земле пришельцев и получать за это баллы. С заданий возвращаются не все.