Прямое продолжение Da Capo II. На этот раз зрители увидят больше знакомых героев из первого сезона. Становится ясно, что все девушки искренно влюблены в Дзюнъити . Это приводит к тому, что Сакура пробуждает магическую сакуру и неосторожно загадывает желание. Жизнь героев переворачивается с ног на голову, и теперь им надо найти способ вернуть всё назад.
Альтернативная история взаимоотношений Дзюнъити Асакуры и Котори Сиракавы.
Остров Хацунэ некогда был известен своими вишнёвыми деревьями, цветущими независимо от времени года. Два года назад вишнёвые деревья острова утратили свою примечательную способность и стали самыми обычными деревьями, цветущими только весной. Дзюнъити Асакура — старшеклассник академии Кадзами на пороге выпуска, окружён друзьями — как новыми, так и старыми. В дождливый летний день у двери дома Дзюнъити появляется загадочная девушка по имени Аисия . Она разыскивает бабушку Сакуры чтобы изучить магию, надеясь принести счастье людям. Когда она узнаёт, что бабушка Ёсино давным-давно умерла, она выдвигает радостное предположение (основанное на некоторой путанице в её выводах), что Дзюнъити может обучить её тому, чему она хочет научиться. Даже несмотря на то, что в конце концов она осознаёт правду, Аисия не унывает и продолжает поиски магии на острове Хацунэ. Посреди её поиска академия Кадзами нанимает новый медперсонал.
Продолжение истории острова Хацунэ и его вечно цветущей сакуры. Прошло 53 года с событий первой части. Главный герой Ёсиюки живёт по соседству с сёстрами Отомэ и Юмэ которые приходятся внучками Дзюнъити и Нэму из первого сезона. Вся история вертится вокруг магического дерева сакуры, исполняющего желания. Прошли годы, и дерево начало исполнять все желания, независимо от того, хорошие они или нет. Главным героям предстоит разобраться с этим и спасти Хацунэдзиму.
Школьник Дзюнъити Асакура обладает сверхспособностями. Он может видеть сны других людей и создавать сладости, но держит свои навыки в секрете. Размеренной жизни Дзюнъити приходит конец, когда из Америки возвращается его подруга детства Сакура Ёсино, которую он не видел 6 лет.
Кагемори Мамору – ничем не приметный парень, в больших очках и с взъерошенной прической. Несмотря на все это, он является членом семьи ниндзя, которая на протяжении четырехсот лет втайне охраняла своих соседей, семью Конняку. Как и предки, Кагемори присматривает за семьей, а точнее за их дочерью Конняку Юной, с тех пор, когда они еще под стол пешком ходили. Если вдруг Юна попадает в беду, Мамору тут же летит на помощь, облачившись в костюм ниндзя.